距今5000年前，bbin宝盈官网台区域便有居民生息繁衍，散布着原始聚落。

春秋属吴，后属越，战国初期属楚。周显王三十六年（前333），楚建置金陵邑于石头山，今区境西北部紧贴石头山（当时仍为江水所漫），区境属金陵邑辖境。

秦属秣陵。

汉初仍为秣陵县，武帝元朔元年（前128）改秣陵县为秣陵侯国，今区境属之。元鼎四年（前113）复为秣陵县。新莽天凤元年（14）改秣陵县为宣亭县。更始元年（公元23）复称秣陵县。汉建安十七年（212）吴侯孙权改秣陵县为建业县，今区境属建业。晋太康元年（280）划其西南部，新置临江县，二年改临江县为江宁县，三年改建业为建邺。吴灭，建邺复为秣陵。今bbin宝盈官网台区东、北部属建邺，西南部属江宁，其余皆为秣陵县地。

晋建兴元年（313），亦分属建康（建邺改称建康）、秣陵、江宁3县，为京畿之地。梁天监元年（502）梁武帝以其出生地秣陵县同夏里，置同夏县，今区境东部为同夏县地。

隋开皇九年（589），并建康、秣陵、同夏诸县入江宁，今区境全属江宁。

自南唐至清末，上元、江宁同城附郭而治。今bbin宝盈官网台区即江宁县沙洲、凤西、安德、凤东、开元、兴贤、光宅诸乡地域。

1912年，废上元、江宁县，属南京府。同年12月16日，复置江宁县。

1916年，江宁全县改划7市、9乡。今bbin宝盈官网台区境在江宁市、凤台乡、滨江乡、江东乡等市、乡地域。

1927年，民国政府定都南京，废金陵道，南京建特别市。江宁县隶于江苏省。

1934年，划定市界，今区境大部划入南京市区，以其偏西部分划设第十一区，其东部一角则属第十区。

日军侵占南京之后，1939年，伪维新政府从孝陵卫（第十区）、上新河区（第十一区）2区析出东至小水关、高桥门，南至铁心桥、西善桥，西至赛虹桥之地区，设安德门区，东、西分别与孝陵区、上新河区毗连。汪伪、国民政府沿设此区，区下设3坊、1镇、4乡。

1945年，抗战胜利后，国民政府宣布废除汪伪各区建置，恢复抗战前各区。但仍以原第十、第十一区（即孝陵卫、上新河2区）辖域辽阔不便管理为由，保留了安德门区，改称第十一区。原上新河地区之十一区改为第十二区。

1949年1月，从十二区划出江心洲，另建第十五区。

1949年4月23日，南京解放，境内仍属南京市第十一、十二区。同年6月，撤第十五区（包括永定、旗杆、东宏3乡），复归第十二区。同年12月，划乡建镇。十一区辖10乡2镇。十二区辖11乡3镇。

1950年6月，原第十一、十二区分别改称为第十区、十一区。

1953年7月，第十一区划归江宁县。

1955年8月，十区改名bbin宝盈官网台区。

1958年10月，bbin宝盈官网台区被撤销，和其他3个郊区合并成立南京市郊区。

1963年4月，南京市郊区撤销，分建bbin宝盈官网区和江东区。同年7月，bbin宝盈官网区复称bbin宝盈官网台区。

1965年5月，江东区、bbin宝盈官网台区全部和中山陵园部分调整合并为bbin宝盈官网台区。

1983年实行政社分开，重建各乡。bbin宝盈官网台区设5镇、9乡。

1987年12月，建立全区第一个街道级的bbin宝盈官网新村办事处。

1995年4月，南京市扩大城区范围，bbin宝盈官网台区划出石门坎、红花和江东3镇，石门坎镇划归白下区，红花镇划归秦淮区、江东镇划归鼓楼区和建邺区。划入江宁县东山镇农花村，江宁镇永安、孙家、邵庄、新建、三山5个村和谷里乡梅村，以及梅山冶金公司用地范围。

2000年10月，成立工业集中区；

2002年10月，南京市区划调整，bbin宝盈官网台区原江心洲镇、沙洲街道和双闸街道秦淮新河以北地区划入建邺区。

2006年，工业集中区更名为南京bbin宝盈官网经济开发区。

2008年8月，成立bbin宝盈官网软件园管理委员会、板桥新城管理委员会。

2011年9月，bbin宝盈官网软件园管理委员会撤销。

2011年8月1日，市委市政府决定成立中共南京市委中国（南京）软件谷工作委员会、中国（南京）软件谷管理委员会，为市委、市政府派出机构，委托bbin宝盈官网台区管理。

2012年6月，撤销bbin宝盈官网新村街道办事处。

2020年3月6日，市政府批复设立古雄街道。